新聞中心

新聞中心
當前所在頁面:首頁>新聞中心>公司新聞

環狀RNA:看完此文,希望對您的課題有所幫助

發布時間: 點擊率:

 

隨著新技術允許科學家們深入研究基因組和外顯子組,一類新的稱為環狀RNA(circular RNA, circRNA)的RNA可能發揮著一種有趣的作用。


在一項新的研究中,來自美國密歇根大學的研究人員對多種癌癥中的circRNA進行了編目,并進行了初步研究,表明這些穩定的結構可能作為血液或尿液中的癌癥生物標志物。相關研究結果發表在2019年2月7日的Cell期刊上,論文標題為“The Landscape of Circular RNA in Cancer”。

圖片來自Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2018.12.021


circRNA是一種非編碼RNA,它們形成閉合的環狀結構而不是線性結構。新的RNA測序方法曝光了這些circRNA,但是人們對它們起作用的原因或方式知之甚少。不過它們的穩定結構使得它們成為癌癥生物標志物的理想候選對象。

這項新的研究確定了癌癥中的circRNA目錄,從而為未來的研究構建了一個數據庫。論文共同通訊作者、密歇根大學轉化病理學中心主任Arul M. Chinnaiyan博士說,“我對circRNA作為非侵入性生物標志物的潛力感到非常興奮。鑒于它們的穩定性,我們可能能夠在癌癥患者的血液或尿液中檢測到它們。這可能對癌癥的診斷或預后有用。”

作為MiONCOSEQ項目的一部分,這些研究人員從800多個腫瘤樣本中發現了circRNA。他們證實為MiONCOSEQ項目開發的捕獲RNA測序在檢測circRNA方面比現有方法更為強大。

Chinnaiyan說,“這種捕獲方法可能是有限的,這是因為它基于我們用來捕獲RNA的探針。但是,全外顯子組捕獲方法使得它具有重大的意義。我們通過這種方式捕獲大量的RNA。這就是為何我們能夠鑒定出如此多的之前并不知道的circRNA。”

這種技術僅需少量總RNA就能夠鑒定出circRNA。這意味著它們可能在RNA被稀釋的地方被檢測到,比如血液或尿液。

此外,這些研究人員還鑒定出幾種在前列腺癌組織中發現的circRNA。通過評估來自前列腺癌細胞的circRNA,他們發現它們比線性RNA更穩定。它們也可在尿液樣品中檢測到。

Chinnaiyan說,“我們能夠證實這些circRNA存在于尿液中并且來自前列腺癌的circRNA可被檢測到。我們未來的研究將探究這些circRNA作為尿液或血液中的癌癥生物標志物。”

這些研究人員將他們的研究結果轉變為一個名為MiOncoCirc的數據庫,這個數據庫對腫瘤樣本中報道的circRNA進行編目。這種資源可供科學家們使用,有助于開發新的癌癥生物標志物。

 

參考資料:Josh N. Vo et al. The Landscape of Circular RNA in Cancer. Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2018.12.021.


circRNA整體解決方案

 

萊博生物是一家綜合的科研服務機構,可為科研工作者提供基因水平、蛋白質水平、細胞水平、組織病理檢測、動物實驗等實驗平臺。公司建立了標準化的實驗室,配備了先進的實驗儀器,可向廣大客戶朋友全程開放。同時,我司擁有數十位博士碩士專業技術人才,資深的技術老師確保全程解決方案優化調整及實驗質控,專業化的實驗人員也保證了實驗操作流程的規范性和實驗結果的價值。萊博生物近年來主攻miRNA、lncRNA、circRNA、外泌體等研究方向,協作了多項國家自然科學基金重大項目、面上、地區、青年項目及各省市科技項目等,為廣大客戶朋友提供了優質的綜合解決方案,廣受好評。

 

具體課題協作服務包括:                                 

實驗設計或優化: 您可以提供完整的課題思路交予我們進行評估優化(或簡化),或告訴我們您的研究方向和大致期望(影響因子等),我們的技術支持團隊會根據您的經費實際及相應要求梳理實驗方案;

實驗開展和匯報: 嚴格根據雙方協商確定的實驗方案進行實驗,我司有完善的實驗平臺和實驗技術人員專業協作;開展過程中,我們將每月定期向您匯報實驗的進展,讓您隨時了解您實驗的動態,以便根據實際情況及時調整實驗方案;

實驗報告與交流: 實驗結束后,我們將及時整理實驗結果,匯成實驗報告單,并協助分析原始數據,及時進行配合交流;

寫作指導與編譯: 我們將針對成稿困難的客戶進行專門指導,有需要的可提供翻譯、潤色等支持,以協助將科研成果更好更快的產出。

 

circRNA整體解決方案:      

環狀RNA(circular RNA,circRNA)是最近發現的一類特殊的非編碼RNA,它大量存在于真核細胞胞質內,主要由pre-mRNA通過可變剪切加工產生。 近年研究發現,circRNA具有很多重要的調控功能,例如,circRNA可以作為競爭性內源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)結合胞內miRNA,阻斷miRNA對其靶基因的抑制作用。除此以外,circRNA也具有調控其他類型RNA、調節蛋白質活性等功能。circRNA在不同物種中具有保守性,而且存在組織表達差異,且circRNA的環狀結構對RNase不敏感,導致它比線性RNA更為穩定,這些特性使得circRNA具有開發疾病新型診斷與治療方法的巨大潛力,研究意義重大。

 

服務內容:

1)環狀RNA生物信息學預測

2) 環狀RNA高通量測序

3)環狀RNA表達豐度檢測

4)FISH 檢測環狀RNA的亞細胞定位

5)NorthernBlot 檢測環化RNA的存在

6)環狀RNA的過表達實驗(Gain of function)

7)環狀RNA功能缺失實驗(Loss of function )

8)環狀RNA與miRNA互作結合生物預測及實驗驗證

9)環狀RNA與miRNA相互作用預測研究

10)環狀RNA與蛋白相互作用研究

circRNA的形成(A)以及作用機制(B)

 

重要意義:

在對circRNA 結構和功能研究的基礎上,有研究人員發現它們在動脈粥樣硬化,神經系統紊亂,糖尿病和腫瘤等疾病發生過程中,發揮非常重要的作用。對環狀RNA研究具有重要的意義:

1)circRNA獨具的競爭性內源(ceRNA)特征可為藥物開發提供新的思路;

2)circRNA的組織特異性和穩定性有可能使circRNA成為一種良好的生物標志物;

3)circRNA 的研究為生命的進化研究提供新的方向。

 

circRNA相關數據庫:

circBase: //www.circbase.org/

circNET: //circnet.mbc.nctu.edu.tw/

StarBase V2: //deepbase.sysu.edu.cn/

CircInteractome: //circinteractome.nia.nih.gov/

Circ2Traits: //gyanxet-beta.com/circdb/

CSCD: //gb.whu.edu.cn/CSCD

exoRBase: //www.exoRBase.org 

 

 

 

定制課題享壕禮


  • 關注服務號

  • 關注訂閱號

Copyright ? 2016廣州維伯鑫生物科技股份有限公司. All Rights Reserved Powered by Vancheer